La Laguna de La Paja se encuentra prácticamente en el centro del término de Chiclana, al sureste del núcleo urbano. Se trata de un espacio, que aún sin reunir los requisitos objetivos que caracterizan a las demás figuras legales de protección de ámbito estatal o autonómico, merece una protección al reunir condiciones ambientales y ecológicas dignas de ser conservadas.
Desde 1994 cuenta con un régimen de protección especial derivado de su declaración como Reserva Natural Concertada. A tal situación se llegó por acuerdo entre la hoy desaparecida Agencia de Medio Ambiente y el Ayuntamiento de Chiclana de la Frontera.
Vegetación y fauna:
Por encima del interés que tuviese la fauna que se concentra en la laguna, es la riqueza en su cobertura vegetal lo que la caracteriza. La zona central la ocupan eneas y bayuncos, y en las zonas aún no colonizadas por estas se halla sumergida Myriophyllum alterniflorum. En las zonas más salinas aparecen Sarcocornia perennis Subsp.. alpini y en los suelos más arenosos se encuentra el junco marítimo.
También se caracteriza por poseer endemismos como Armeria gaditana, Eryngium galioides y Frankenia boissieri.